文章摘要:药用植物是中医临床用药的主要来源，我国已经实现药用植物的大规模栽培和生产。微生物作为未来农业可持续发展的重要资源，同样也将推动中药农业的绿色、生态、高质量发展。然而，有关药用植物微生物组的研究还非常有限，因此该文以微生物组研究的发展时间线为基础，对微生物组研究的起源、技术和热点进行综述，结合药用植物微生物组的研究现状，对未来的研究重点提出几点建议：①依据科、属、种对不同化学型药用植物的微生物组进行系统研究，揭示药用植物与微生物的共进化过程；②开展药用植物微生物组在时间和空间尺度的研究，掌握微生物对药用植物生长发育和次生代谢产物积累的作用规律；③寻找合适的药用植物模式物种，建立药用植物与微生物互作的研究模型；④挖掘药用植物核心微生物组，将核心微生物组成员应用于中药生态农业；⑤推进药用植物微生物育种的研究工作，为药用植物育种提供新的途径；⑥利用高通量测序和传统培养分离相结合的方法研究药用植物微生物组，加快未培养微生物菌株的开发和利用；⑦建设药用植物微生物菌种保藏平台及其代谢产物数据库，加强交流与合作，实现数据共享。以此来推动药用植物微生物组研究的高效、快速发展。

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